人工智能应用于高维单细胞数据可视化

高维单细胞技术正在彻底改变我们理解生物系统的方式。诸如质谱细胞仪等技术同时测量单个细胞中的几十个参数,使解释工作变得十分困难。

viSNE 是一个可以将高维细胞仪数据映射到二维,同时不丢失高维信息结构的创新算法。

我们将质谱细胞仪与viSNE整合在一起,将健康骨髓和癌性骨髓样本进行映射。健康的骨髓可以映射成一个可区分免疫亚型的典型形状,但白血病患者的骨髓,得到的形状是畸形的:癌症样本的分型与健康样本的分型是相互不同的。

viSNE突出了癌症中表面表型表达的异质性中的结构,穿越了从诊断到复发的进展,并在最小的残留疾病环境中识别出罕见的白血病人群。随着几种新技术将每个细胞中同时测量的参数数量提高到数百个,viSNE将成为分析和解释此类实验的主流。